ラニアケア銀河

Galaxyコミュニティが開発したロールを使用して、Galaxy 23.0をインストールするためのAnsibleロールです。

必要要件

必要なロール：

• src: galaxyproject.galaxy version: 0.10.14
• src: galaxyproject.nginx version: 0.7.1
• src: galaxyproject.postgresql version: 1.1.2
• src: galaxyproject.postgresql_objects version: 1.2.0
• src: geerlingguy.pip version: 2.0.0
• src: galaxyproject.miniconda version: 0.3.1
• src: usegalaxy_eu.certbot version: 0.1.11
• src: galaxyproject.tusd version: 0.0.1
• src: galaxyproject.cvmfs version: 0.2.14

Ansibleバージョン

テスト済み：Ansible 4.10.0、Ansibleコア 2.11.12

タスク

main.ymlには、すべての必要なサブロールが含まれています。

pre_tasks.ymlは、OSごとに特化した一連のpre_tasksを呼び出します：CentOS7またはRockyLinux9用。

変数

• ラニアケア変数: vars/main.yml
• デフォルト変数（管理者、パス）：defaults/mail.yml
• ロール特有の変数はタスクファイルにあります：
  • PostgreSQL: tasks/postgresql_objects.yml
  • NGINX: tasks/nginx.yml
  • Galaxy: tasks/install_galaxy_role_vars.yml
  • TUSD: tasks/tusd.ymlおよび部分的にtasks/install_galaxy_role_vars.yml

ローカルテスト実行

# 空のVM上で
# 要件をインストール
sudo yum install -y git pip vim
pip install ansible==4.10.0 ansible-core==2.11.12
# リポジトリをクローン
git clone <repo_path>
# テストプレイブックをコピー
cp ansible-role-laniakea-galaxy/tests/test.yml test.yml
# ホスト名とansibleユーザーを更新
vim inventory
ansible-galaxy install -r ansible-role-laniakea-galaxy/requirements.yml
cd ../
# プレイブックを実行
ansible-playbook -i ansible-role-laniakea-galaxy/inventory test.yml

ログ:

• <galaxy_install_path>/var/gravity/log/（デフォルトパス /home/galaxy/galaxy/var/gravity/log/）- Gravityログファイル：
  • gunicorn
  • handlers
  • celery
  • tusd
  • インタラクティブツール（有効な場合）
• sudo journalctl -u galaxy すべてのGalaxyログ（スーパーバイザーからのもので、/home/galaxy/galaxy/var/gravity/supervisor/supervisord.logにあります）

例のプレイブック

 ---

 - hosts: galaxyservers
   become: true
   vars:
     GALAXY_ADMIN_USERNAME: ""
     GALAXY_ADMIN_PASSWORD: ""
     GALAXY_ADMIN_API_KEY: ""
     GALAXY_ADMIN_EMAIL: ""
   roles:
     - ansible-role-laniakea-galaxy

ライセンス

Apacheライセンス v2

http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0

著者情報

Pietro Mandreoli メール: pietro.mandreoli@unimi.it
Polina Khmelevskaia: khmelevskayapv@gmail.com