Oefenweb.latest_r

概要バージョン洞察

r

Ubuntuシステムに最新のRをセットアップします。

要件

littler（インストールされます）
bash（インストールされません）
software-properties-common（インストールされます）
dirmngr（インストールされます）
apt-transport-https（インストールされます）

変数

r_version: [デフォルト: 34, 35（Ubuntu >= 18.04用）, 40（Ubuntu >= 20.04用）]: インストールするバージョン
r_cran_mirror: [デフォルト: https://cran.rstudio.com/]: お好みのCRANミラー
r_bioclite_url: [デフォルト: https://bioconductor.org/biocLite.R]: Bioconductorインストール用のbiocLite.RスクリプトのURL
r_install_dev: [デフォルト: false]: r-base-devパッケージをインストールするかどうか
r_install: [デフォルト: ['littler']]: インストールする追加の（apt）パッケージ（例: r-recommended）
r_packages_lib: [デフォルト: /usr/local/lib/R/site-library]: パッケージをインストールする（デフォルトの）ライブラリディレクトリ
r_packages_repos: [デフォルト: "{{ r_cran_mirror }}"]: パッケージをインストールする（デフォルトの）URL
r_packages: [デフォルト: []]: インストールまたは削除する（CRAN）パッケージ
r_packages.{n}.name: [必須]: パッケージの名前
r_packages.{n}.state: [オプション, デフォルト: present]: パッケージの状態（例: updated, absent）
r_packages.{n}.type: [オプション, デフォルト: cran]: パッケージの種類（例: bioconductor）
r_packages.{n}.lib: [オプション, デフォルト: r_packages_lib]: パッケージをインストールするライブラリディレクトリ
r_packages.{n}.repos: [オプション, デフォルト: r_packages_repos]: パッケージをインストールするURL
r_environment: [デフォルト: {}]: 環境変数を設定する（パッケージのインストール、更新または削除のタスク中）
r_scripts_install_path: [デフォルト: /usr/local/bin]: Rパッケージのインストール、更新、削除に使用するRスクリプトをインストールするパス
r_scripts_install_owner: [デフォルト: root]: Rパッケージのインストール、更新、削除用のRスクリプトの所有者
r_scripts_install_group: [デフォルト: root]: Rパッケージのインストール、更新、削除用のRスクリプトのグループ

依存関係

なし

例

シンプル

---
- hosts: all
  roles:
    - oefenweb.r

高度な例

---
- hosts: all
  roles:
    - oefenweb.r
  vars:
    r_install_dev: true
    # aptパッケージ
    r_install:
      - r-recommended
    # cran, bioconductor, または github (R) パッケージ
    r_packages:
      - name: dplyr
      - name: Biobase
        type: bioconductor
      - name: mangothecat/franc
        type: github